Для
хранения генетической информации ВИЧ, как и многие другие вирусы,
использует однонитевые РНК, причем в кодировании данных участвуют
как нуклеотидная последовательность (на каждой из двух содержащихся
внутри капсида нитей РНК располагается около 10 тысяч нуклеотидов), так
и элементы вторичной структуры (петли, стебли «шпильки»), формируемой
с помощью водородных связей. Ранее ученые анализировали лишь небольшие
участки генома, не получая данных об общей структуре.
Авторы
рассматриваемой работы применили оригинальную технологию исследования
РНК, получившую название SHAPE (high-throughput selective 2'-hydroxyl
acylation analysed by primer extension, высокопроизводительное
выборочное ацилирование, анализируемое методом удлинения праймера). В
основу методики положен тот факт, что способность нуклеотидов
исследуемой молекулы взаимодействовать с определенными химическими
веществами зависит от того, участвует ли данный нуклеотид в образовании
элементов вторичной структуры.
Построив на базе собранных данных
модель генома вируса, авторы выявили сложную структуру тех участков
РНК, которые кодируют протеины. По мнению ученых, обнаруженные
структурные элементы должны каким-то образом воздействовать на процессы
трансляции и сворачивания белков.
«Наконец-то мы начинаем
понимать, какие “уловки” помогают вирусу преодолевать защитные системы
организма человека», — заключает один из участников исследования Кевин
Уикс (Kevin Weeks), передает Science.compulenta.
Напомним,
молекулярный выключатель ВИЧ был найден в 2007 году. Леор Вейнбергер
и Томас Шенк из университета Принстона выяснили, что вирус
иммунодефицита человека (ВИЧ), заразивший клетки иммунной системы,
можно заставить перейти в «спящий» режим.
Ученые разобрались
в цепочках биохимических реакций, влияющих на молекулярные сигналы,
заставляющие ВИЧ приступить к копированию самого себя. Они обнаружили.
что баланс между синтезом двух белков (p300 и SirT1) в зараженной
клетке может оказаться тем переключателем, который будет определять
размножение вируса или нахождение его в «спящем» режиме.
Авторы
работы утверждали, что, теперь возможно создать препарат, который будет
держать обнаруженный ими переключатель в положении «выключено» и ВИЧ
останется в организме пассивным.
До сих пор лекарство от чумы XX
века не найдено. В РФ общее число ВИЧ-инфицированных россиян,
регистрация которых ведется с 1987 года, составила 467 тыс. 16 человек.
Как
ранее сообщалось, в настоящее время в разработке находятся не менее 30
различных вариантов вакцин для лечения и профилактики ВИЧ-инфекции.
Последней фазы клинических испытаний достиг единственный препарат –
комбинация вакцин для профилактики ВИЧ-инфекции, разработанных
компаниями Sanofi Pasteur и VaxGen. Исследование, к которому привлечено
более 16 тыс. добровольцев, проходит в Таиланде.